港大成立的两所实验室，是首间及唯一在境外批准成立之同类型国家重点实验室，分别为新发传染性疾病国家重点实验室，及脑与认知科学国家重点实验室。
香港大学的新发传染性疾病国家重点实验室位于医学院，实验室包括生物安全三级实验室和病毒、细胞和分子生物学实验室。研究方向重点放在新发传染性疾病，包括病毒、细菌、真菌及抗药性等。
脑与认知科学国家重点实验室是香港首个跨学科研究中心，由语言学、解剖学、心理学、诊断放射学和基因组学所组成。该实验室获国家重点业础研究计划拨款二千五百万元人民币，资助五年，进行改善人类健康、了解学习和认知的神经机理，用以提高人的能力和教育质量。
国家把重点实验室视为国家科技研究体系的重要组成部分，认为是国家组织高水平基础研究和应用基础研究、聚集和培养优秀科学家、开展学术交流的重要基地。
